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首個(gè)不依賴已知抗體的AI特定表位抗體從頭設(shè)計(jì)平臺(tái)獲驗(yàn)證,一鍵生成抗體時(shí)代來臨

首個(gè)不依賴已知抗體的AI特定表位抗體從頭設(shè)計(jì)平臺(tái)獲驗(yàn)證,一鍵生成抗體時(shí)代來臨

近日,由晶泰科技創(chuàng)新中心與百奧賽圖聯(lián)合創(chuàng)立的科邁生物科技(蘇州)有限公司宣布,由其研發(fā)的全球首個(gè)內(nèi)部數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)的AI人源抗體從頭設(shè)計(jì)平臺(tái)獲里程碑進(jìn)展,首次實(shí)現(xiàn)不依賴已知抗體的AI抗體從頭設(shè)計(jì),針對(duì)指定表位僅用5天便計(jì)算獲得全新抗體起始候選分子。

進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證表明,這些抗體具有良好的親和力,有望在優(yōu)化后作為PCC向臨床推進(jìn)。科邁生物的AI抗體從頭設(shè)計(jì)平臺(tái)突破濕實(shí)驗(yàn)帶來的研發(fā)局限,將傳統(tǒng)上需要4-6個(gè)月的研發(fā)流程縮短到數(shù)周,且更加精確高效,覆蓋傳統(tǒng)方法下“難成藥”的抗原靶點(diǎn),為抗體藥物研發(fā)帶來范式革新。

抗體藥由于其更強(qiáng)的靶向性、安全性和長(zhǎng)效性等獨(dú)特優(yōu)勢(shì),在腫瘤、自免和病毒感染等疾病領(lǐng)域的治療中的應(yīng)用越來越廣泛,備受藥企追捧。據(jù)分析機(jī)構(gòu)Global Market Insights報(bào)道,全球抗體藥物市場(chǎng)在2021年已突破1861億美元,并將在未來幾年維持高增長(zhǎng)率,預(yù)計(jì)在2028年達(dá)到4456億美元。

當(dāng)前的抗體研發(fā)方法依賴小鼠免疫、噬菌體展示篩選等濕實(shí)驗(yàn)手段驅(qū)動(dòng),昂貴耗時(shí),且表位針對(duì)性不明確,不僅無法根據(jù)生物學(xué)功能與藥效靶向抗原上的特定表位,也不能對(duì)動(dòng)物免疫實(shí)驗(yàn)中較難產(chǎn)生抗體的低免疫原性表位進(jìn)行研究,且后期開發(fā)中仍面臨人源性、可開發(fā)性等諸多挑戰(zhàn),難以獲得理想的抗體,極大地局限了抗體藥的研發(fā)。

科邁生物立足晶泰科技創(chuàng)新中心的AI算法研發(fā)能力與百奧賽圖獨(dú)特的全人抗體小鼠RenMice平臺(tái)產(chǎn)生的高質(zhì)量全人抗體序列,以此訓(xùn)練的深度學(xué)習(xí)生成式模型可以模擬小鼠免疫系統(tǒng)抗體生成過程中的體細(xì)胞超突變(Somatic hypermutation)過程,產(chǎn)生具備高人源化和高親和力的優(yōu)質(zhì)抗體序列。

在此基礎(chǔ)上,科邁生物建立了一套高效的抗體從頭設(shè)計(jì)AI計(jì)算流程,通過整合一系列自主研發(fā)的抗原特異性抗體挑選、抗原表位預(yù)測(cè)、抗體親和力預(yù)測(cè)等模型與進(jìn)化算法,可針對(duì)指定的抗原表位,從頭設(shè)計(jì)具有高親和力和特異性結(jié)合能力的候選抗體分子。有別于已獲報(bào)道的其他抗體從頭設(shè)計(jì)方法,科邁生物的AI抗體設(shè)計(jì)流程不依賴任何已知的目標(biāo)表位結(jié)合抗體,突破性地實(shí)現(xiàn)從0到1的AI抗體從頭設(shè)計(jì),極大地拓展了可成藥抗體發(fā)現(xiàn)的空間,有潛力支持晶泰科技的AI抗體藥發(fā)現(xiàn)業(yè)務(wù)。

在最近的一個(gè)測(cè)試案例中,針對(duì)訓(xùn)練集中未出現(xiàn)過的目標(biāo)表位,科邁通過 AI 計(jì)算流程從頭設(shè)計(jì)出 100 萬條抗體,并挑選 10 條進(jìn)行表達(dá),以 5 天的計(jì)算節(jié)省了幾十萬到幾百萬的抗體實(shí)驗(yàn)。經(jīng)多濃度 BLI 技術(shù)測(cè)定,其中 2 條抗體親和力 KD 分別達(dá)到 194 nM 和 336 nM,有很大潛力作為起始候選分子,在進(jìn)一步優(yōu)化和體內(nèi)外實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證后向臨床推進(jìn)。

科邁生物的AI抗體從頭生成平臺(tái)具有速度快、準(zhǔn)確度高、成本低的優(yōu)勢(shì),將從前需要幾個(gè)月的抗體發(fā)現(xiàn)流程縮短到幾周,且適用于低免疫原性和難以穩(wěn)定表達(dá)的GPCR等多次跨膜類靶點(diǎn)蛋白上的表位,將“難成藥”靶點(diǎn)納入研發(fā)射程,具備極高的應(yīng)用價(jià)值。

同時(shí),新抗體基于全人共輕鏈小鼠抗體數(shù)據(jù)生成,不僅具有天然的高人源化程度與優(yōu)秀的可開發(fā)性,能從源頭降低后續(xù)CMC風(fēng)險(xiǎn),還能有效解決輕重鏈錯(cuò)配問題,在多特異性抗體發(fā)現(xiàn)中也格外具有優(yōu)勢(shì)。這一成果驗(yàn)證了僅憑AI生成生物藥的可行性和優(yōu)越性,為AI從頭設(shè)計(jì)功能性抗體的工業(yè)應(yīng)用奠定基礎(chǔ)。

科邁生物AI抗體從頭設(shè)計(jì)平臺(tái)的成功標(biāo)志著AI抗體藥研發(fā)迎來爆發(fā)點(diǎn),首次驗(yàn)證了AI算法超越濕實(shí)驗(yàn)與已知樣本庫限制的創(chuàng)新潛力,能定制生成具有表位特異性和高親和力的全新抗體,從而精確滿足特定的生物學(xué)功能,拓展抗體藥適用靶點(diǎn),在更廣闊的可成藥抗體序列空間創(chuàng)造價(jià)值。

科邁生物董事長(zhǎng)、CEO黃小魯表示,“本次階段性的實(shí)驗(yàn)結(jié)果,驗(yàn)證了人工智能從頭生成抗體序列的可行性,以及新的抗體數(shù)據(jù)支持下模型提升的巨大潛力,是晶泰科技用人工智能手段模擬免疫關(guān)鍵環(huán)節(jié)的有益探索??七~生物的數(shù)字化抗體生成技術(shù)不受體內(nèi)免疫反應(yīng)限制,為抗體藥摘取靶點(diǎn)中的‘高懸果實(shí)’提供了更加高效的全新途徑?!?/p>

晶泰科技聯(lián)合創(chuàng)始人、首席創(chuàng)新官賴力鵬表示,“科邁生物在AI抗體設(shè)計(jì)領(lǐng)域的突破很好地展示了高相關(guān)性實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)與AI相結(jié)合所能產(chǎn)生的巨大價(jià)值。很高興晶泰科技能深度參與其中。晶泰創(chuàng)新中心也將與合作伙伴們一起,持續(xù)探索AI、計(jì)算模擬及自動(dòng)化技術(shù)在包括抗體設(shè)計(jì)、疫苗研發(fā)、臨床前及臨床研發(fā)中的突破與價(jià)值轉(zhuǎn)化。”

接下來,科邁生物將持續(xù)投入AI抗體平臺(tái)的開發(fā),積累更多高質(zhì)量的數(shù)據(jù),繼續(xù)提高預(yù)測(cè)算法的效率和準(zhǔn)確度,拓展其抗體編程能力,在更廣闊的范圍內(nèi)實(shí)現(xiàn)更加精確的抗體從頭設(shè)計(jì)。

●?關(guān)于科邁生物?●?


科邁生物是一家聚焦于抗體藥物早期發(fā)現(xiàn)的生物技術(shù)公司,由晶泰科技和百奧賽圖于2021年6月共同出資成立,通過自主生成的高質(zhì)量人源抗原抗體配對(duì)數(shù)據(jù),打造了行業(yè)首個(gè)以數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)的特定表位AI抗體從頭設(shè)計(jì)平臺(tái)并獲得實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。該平臺(tái)突破性地實(shí)現(xiàn)在沒有動(dòng)物免疫實(shí)驗(yàn)、抗體篩選庫的前提下,以AI從0到1生成能與特定表位結(jié)合的抗體分子,為行業(yè)帶來第三種抗體發(fā)現(xiàn)來源,顯著拓展抗體藥發(fā)現(xiàn)的空間。

科邁生物致力于打造AI與真實(shí)數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)的B細(xì)胞編程平臺(tái),探索全新的抗體藥研發(fā)模式,以AI算法模擬并超越人體的自然免疫過程,從而加速設(shè)計(jì)出靶向精確、可開發(fā)性強(qiáng)的抗體分子,填補(bǔ)臨床用藥空白,讓更加安全、高效的生物藥早日來到患者身邊。

人工智能 + 機(jī)器人
技術(shù)平臺(tái)驅(qū)動(dòng)行業(yè)創(chuàng)新

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